Koncepcja Szkoły Promującej Zdrowie opiera się na założeniu, że szkoła jest miejscem, w którym kształtuje się zdrowie i dobre samopoczucie całej społeczności szkolnej. Obejmuje ona uczniów, nauczycieli, pracowników szkoły oraz rodziców.
Szkoła promująca zdrowie traktuje zdrowie w sposób całościowy – jako dobrostan fizyczny, psychiczny i społeczny. Podkreśla związek między zdrowiem a procesem uczenia się, wskazując, że dobre zdrowie sprzyja edukacji, a edukacja wspiera zdrowie.
Działania szkoły koncentrują się na dwóch obszarach: tworzeniu środowiska sprzyjającego zdrowiu oraz rozwijaniu kompetencji zdrowotnych uczniów i pracowników. Ważne jest także budowanie pozytywnego klimatu społecznego oraz współpraca całej społeczności szkolnej.
Koncepcja zakłada, że działania prozdrowotne nie są jednorazowe, lecz stanowią stały element funkcjonowania szkoły i jej organizacji.